Научный сотрудник-биоинформатик

80 000 руб
Размещено 05 марта


Обязанности:1. Написание компьютерных программ для решения аналитических задач (анализ геномных, метагеномных и транскриптомных данных);2. Разработка и автоматизация алгоритмов для анализа геномных и метагеномных данных, фильтрации, интеграции, кластеризации, аннотирования данных;3. Подбор и тестирование праймерных последовательностей;4. Участие в разработке универсальных скрининговых систем;5. Визуализация и презентация данных;6. Представление результатов в виде научных статей, написание научных статей;7. Управление и обработка больших наборов данных на RStudio Server;8. Составление отчетной документации.Требования:1. Теоретические знания молекулярной биологии и генетики;2. Опыт написания научных статей и желание их писать;3. Умение и опыт обработки данных высокопроизводительного секвенирования;4. Умение и опыт работы с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm)5. Знание программного обеспечения для биоинформатики Linux;6. Опыт программирования на  Python, Perl, R, Java или С/С+7. Уверенное владение Python;8. Владение biopython;9. Владение библиотеками для статистической обработки и визуализации данных (pandas, numpy, matplotlib);10. Знание синтаксиса SQL;11. Картирования прочтений и аннотации вариантов нуклеотидной последовательности (bwa, Samtools, bcftools, GATK);12. Преимуществом будет владение программными пакетами для:-сборки геномов de novo;- сборки геномов по референсу;- алгоритмов поиска и таксономической классификации;- построения попарных и множественных  выравниваний последовательностей;- проведения филогенетического анализа.